MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli DH1

Total Repeats: 82759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017638	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387619775
2	NC_017638	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387619775
3	NC_017638	CGG	2	6	355	360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619776
4	NC_017638	CAGG	2	8	421	428	25 %	0 %	50 %	25 %	387619776
5	NC_017638	CT	3	6	446	451	0 %	50 %	0 %	50 %	387619776
6	NC_017638	ACCA	2	8	467	474	50 %	0 %	0 %	50 %	387619776
7	NC_017638	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619776
8	NC_017638	GAT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619776
9	NC_017638	A	6	6	492	497	100 %	0 %	0 %	0 %	387619776
10	NC_017638	CGC	3	9	571	579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619776
11	NC_017638	TCG	2	6	615	620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619776
12	NC_017638	TTG	2	6	665	670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387619776
13	NC_017638	CGCTG	2	10	694	703	0 %	20 %	40 %	40 %	387619776
14	NC_017638	GC	3	6	755	760	0 %	0 %	50 %	50 %	387619776
15	NC_017638	CTG	2	6	797	802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619776
16	NC_017638	CCG	2	6	850	855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619776
17	NC_017638	CCG	2	6	909	914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619776
18	NC_017638	TGG	2	6	933	938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619776
19	NC_017638	ACT	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619776
20	NC_017638	CTG	2	6	966	971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619776
21	NC_017638	GCTG	2	8	976	983	0 %	25 %	50 %	25 %	387619776
22	NC_017638	TTG	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387619776
23	NC_017638	GGAC	2	8	1014	1021	25 %	0 %	50 %	25 %	387619776
24	NC_017638	GTT	2	6	1069	1074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387619776
25	NC_017638	TTC	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387619776
26	NC_017638	TGA	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619776
27	NC_017638	GGC	2	6	1330	1335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619776
28	NC_017638	GC	3	6	1334	1339	0 %	0 %	50 %	50 %	387619776
29	NC_017638	GTG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619776
30	NC_017638	ATC	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619776
31	NC_017638	TG	3	6	1436	1441	0 %	50 %	50 %	0 %	387619776
32	NC_017638	AAG	2	6	1485	1490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387619776
33	NC_017638	GGT	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619776
34	NC_017638	TCT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387619776
35	NC_017638	GAT	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619776
36	NC_017638	TCA	2	6	1702	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619776
37	NC_017638	GCT	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619776
38	NC_017638	GCTG	2	8	1803	1810	0 %	25 %	50 %	25 %	387619776
39	NC_017638	AGAA	2	8	1902	1909	75 %	0 %	25 %	0 %	387619776
40	NC_017638	ATC	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619776
41	NC_017638	TTG	2	6	1989	1994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387619776
42	NC_017638	CCAG	2	8	2004	2011	25 %	0 %	25 %	50 %	387619776
43	NC_017638	TCG	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619776
44	NC_017638	TAC	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619776
45	NC_017638	GCG	2	6	2120	2125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619776
46	NC_017638	TGA	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619776
47	NC_017638	TGA	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619776
48	NC_017638	TTCT	2	8	2241	2248	0 %	75 %	0 %	25 %	387619776
49	NC_017638	GAT	2	6	2351	2356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619776
50	NC_017638	ATTGAA	2	12	2432	2443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387619776
51	NC_017638	TGC	2	6	2448	2453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619776
52	NC_017638	CGA	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619776
53	NC_017638	CG	4	8	2527	2534	0 %	0 %	50 %	50 %	387619776
54	NC_017638	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619776
55	NC_017638	TGA	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619776
56	NC_017638	TAT	2	6	2687	2692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387619776
57	NC_017638	GCG	2	6	2865	2870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619777
58	NC_017638	GGC	2	6	2918	2923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619777
59	NC_017638	CAA	2	6	2939	2944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387619777
60	NC_017638	GGT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619777
61	NC_017638	ATGA	2	8	3129	3136	50 %	25 %	25 %	0 %	387619777
62	NC_017638	GCA	2	6	3208	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619777
63	NC_017638	GGT	2	6	3246	3251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619777
64	NC_017638	TGA	2	6	3259	3264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619777
65	NC_017638	GAA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387619777
66	NC_017638	CAT	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619777
67	NC_017638	CAGC	2	8	3284	3291	25 %	0 %	25 %	50 %	387619777
68	NC_017638	TGA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619777
69	NC_017638	CGC	2	6	3387	3392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619777
70	NC_017638	ATTGC	2	10	3397	3406	20 %	40 %	20 %	20 %	387619777
71	NC_017638	TTCA	2	8	3429	3436	25 %	50 %	0 %	25 %	387619777
72	NC_017638	TGA	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619777
73	NC_017638	AGCG	2	8	3566	3573	25 %	0 %	50 %	25 %	387619777
74	NC_017638	TCCGGC	2	12	3579	3590	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387619777
75	NC_017638	TG	3	6	3607	3612	0 %	50 %	50 %	0 %	387619777
76	NC_017638	CGG	2	6	3706	3711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619777
77	NC_017638	T	6	6	3822	3827	0 %	100 %	0 %	0 %	387619778
78	NC_017638	CTGA	2	8	3852	3859	25 %	25 %	25 %	25 %	387619778
79	NC_017638	TGA	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619778
80	NC_017638	TGA	2	6	3926	3931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619778
81	NC_017638	GC	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	387619778
82	NC_017638	CGG	2	6	4061	4066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619778
83	NC_017638	GGC	2	6	4254	4259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619778
84	NC_017638	TGA	3	9	4325	4333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619778
85	NC_017638	CTA	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619778
86	NC_017638	CGG	2	6	4495	4500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619778
87	NC_017638	CTG	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619778
88	NC_017638	TGC	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619778
89	NC_017638	ACG	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619778
90	NC_017638	AAC	2	6	4653	4658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387619778
91	NC_017638	GTT	2	6	4676	4681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387619778
92	NC_017638	CCG	2	6	4682	4687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619778
93	NC_017638	GAT	2	6	4728	4733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619778
94	NC_017638	AG	3	6	4883	4888	50 %	0 %	50 %	0 %	387619778
95	NC_017638	CCG	2	6	4975	4980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619778
96	NC_017638	TGC	2	6	4985	4990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619778
97	NC_017638	TGA	3	9	5002	5010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619778
98	NC_017638	ATC	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619778
99	NC_017638	GCA	2	6	5292	5297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387619779
100	NC_017638	TGG	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619779
101	NC_017638	ACA	2	6	5408	5413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387619779
102	NC_017638	CCG	2	6	5451	5456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619779
103	NC_017638	CCG	2	6	5460	5465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619779
104	NC_017638	CCA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387619779
105	NC_017638	CTC	2	6	5482	5487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387619779
106	NC_017638	ATC	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619779
107	NC_017638	CGG	2	6	5498	5503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387619779
108	NC_017638	GCT	2	6	5689	5694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619780
109	NC_017638	GGA	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387619780
110	NC_017638	TCA	2	6	5736	5741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619780
111	NC_017638	AAG	2	6	5742	5747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387619780
112	NC_017638	CAGT	2	8	5767	5774	25 %	25 %	25 %	25 %	387619780
113	NC_017638	AAT	2	6	5801	5806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387619780
114	NC_017638	TCA	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619780
115	NC_017638	TGA	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619780
116	NC_017638	TTC	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387619780
117	NC_017638	TTC	2	6	5913	5918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387619780
118	NC_017638	CAC	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387619780
119	NC_017638	TGC	2	6	5978	5983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619780
120	NC_017638	TTG	2	6	6000	6005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387619780
121	NC_017638	TGA	2	6	6007	6012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387619780
122	NC_017638	GCGG	2	8	6100	6107	0 %	0 %	75 %	25 %	387619780
123	NC_017638	AAATCG	2	12	6153	6164	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387619780
124	NC_017638	AGCG	2	8	6271	6278	25 %	0 %	50 %	25 %	387619780
125	NC_017638	CTG	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387619780
126	NC_017638	GTG	2	6	6402	6407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387619780
127	NC_017638	CAT	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619781
128	NC_017638	GCC	2	6	6761	6766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619781
129	NC_017638	GTT	2	6	6815	6820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387619781
130	NC_017638	AGA	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387619781
131	NC_017638	ATC	2	6	7059	7064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387619781
132	NC_017638	CGC	2	6	7103	7108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387619781
133	NC_017638	TGCCGC	2	12	7109	7120	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387619781
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